苹果树是通过根把土壤和树体紧密联系在一起。土壤作为载体，通过根系，不但把树牢牢地固定在土地上，同时，土壤容纳大量的矿质元素和水，为树体的生长发育提供必需的养分和水分。不同质地的土壤，由于理化性状、养分水分及供肥水平的不同，对苹果树带来不同的生长发育表现（茂盛、衰弱）。发育良好的苹果树，一般都是生长在有良好条件下的土壤上，同时还可以看出，定植在优良土壤（家生的，或者改良的土壤）上的苹果树长势旺、发育快、早结果、早丰收、质量好、效益高，这就充分说明了土壤与果树生长发育的密切关系。
苹果树根系生长发育要求把土壤改造成活土层深，肥力高，土质疏松，保水能力强，温差缓稳的环境条件，为苹果树根系活动提供自由空间。
深翻适应于新建果园，按照一定的深度，对土壤进行全面翻动，加深活土层，打通障碍层，提高通气性，为根系伸展开辟顺畅通道。免耕适应老果园，树大根密，不便深翻，可给地面喷施“免深耕”土壤调理剂，1年使用1次，使土壤疏松土层达40～50厘米，在不伤根的情况下，起到与深翻相同的效果，可以替代果园土壤深翻，解决了深翻和不深翻的争议问题。“免深耕”可打破土壤板结，疏松土壤改良土壤结构。
我国多数苹果园分布在山地、丘陵地和沙滩地上，存在土层薄、养分不均衡、有机质含量低、透气性差和保水保肥能力低等不利果树生长和优质丰产的因素，通过施用有机肥，除可提供果树必需的氮、磷、钾、钙、镁、锌、硼、铁等外，更重要的是还可提高果园土壤有机质含量、增强土壤透气性，提高果园土壤保肥、供肥的能力，促进根系生长发育，为化肥的高效利用提供保证。提高果园土壤有机质与腐殖酸的办法较多，主要是向果园大量施入腐熟的猪、鸡、人类尿等有机肥和沼渣、沤肥、堆肥等，还有如落叶，作物秸秆，杂草等深埋地下均可。
有机肥主要包括农家肥、生物有机肥、豆饼、鱼腥肥等。有机肥用量采用斤果斤肥的原则，生物有机肥、豆饼、鱼腥肥等可以减少1/3或1/2。有机肥的施肥时期以秋季即中熟品种采收后、晚熟品种采收前为最佳，一般为9月下旬至10月上旬。一般而言，667平方米施有机肥3000～4000千克。
果园覆草可有效减少水分蒸发，拦蓄降雪，起到保水防旱的作用；可保持土温稳定，减少水土流失，稳定根层土壤环境；覆草还可显著增加土壤有机质含量。覆盖前要先整好树盘，浇1遍水，施1次速效氮肥，防止叶片发黄。
经调查连续3年覆草10～20厘米厚，土壤有机质达到1.13%，比翻耕果园提高0.36%，土壤含水量一般稳定在13.5%～18.9%，土壤容量由原来的1.40降低到1.28，增产23.8%。覆草适用于山丘地、沙土地，土层薄的地块效果尤其明显，但黏土地覆草由于易使果园土壤积水、引起旺长或烂根，不宜进行。冬季较冷地区深秋覆草1次，可保护根系安全越冬。覆草果园要注意防火。风大地区可零星在草上压土、石块、木棒等防止草被大风吹走。
生草栽培即在果树行间树盘外的区域播种草本植物、防止土壤暴露的土壤管理方法，所选草类以禾本科、豆科为宜。生草栽培在贫瘠、土层深、易水土流失的园片采用效果好。果园生草或生草后刈割覆盖地面，能缓和降雨对土壤的直接侵蚀和水土流失；在夏季可有效降低土壤的表层温度，提高近地表和冠层的相对湿度。草的残体在土壤中降解、转化，可形成腐殖质，提高土壤中的有机质含量，改善土壤物理性状。果园生草可人工种植，也可自然生草后人工管理。
果园人工种草一般选择黑麦草、羊茅、紫花苜蓿、三叶草、沙打旺等。自然生草对自由生长的杂草，进行人工调整，及时拔除豚草、飞蓬等有害杂草，保留下的草旺盛生长后进行刈割等人工管理。不论人工种草还是自然生草，在草旺盛生长季节都要刈割2～3次，割后保留10厘米高，将割下的草覆于树盘下。
平原黏地土壤通透性差，早春低温回升慢，影响根系活动；雨季容易积水，导致根系窒息，引起早期落叶，影响植株生长发育。起垄后增加了水分散失的面积，垄在地平面以上，土壤不板结，透气性大幅度提高。新建果园沿定植行线将行间的表土沿行向培成垄栽植，垄为弧形，高20～50厘米，底宽1.5～2.0米；起垄后提倡滴灌给水，沿每行铺设1条管，盖黑地膜防草。如果没有滴灌条件，可以靠近垄边挖沟进行沟灌。秋季施土杂肥时将垄挖开，按照常规施肥方法施入后再将垄修整好即可。
果园在幼龄期，相邻树冠间枝条没有交叉，可在行间间作其他作物，以提高土地利用率，增加早期效益。但如果间作玉米、高粱等高秆作物生长量大，占据大量空间，与果树争肥水，并严重影响果树通风透光，因此，必须间作低秆作物，并且间作时必须给果树留出足够的营养空间，幼树干周1米内不得种植间作物。果园不宜间作大白菜、萝卜等秋菜，以免加重大青叶蝉为害，秋菜大量灌水施肥也引起果树贪青，影响安全越冬。
间作物选择的原则是：矮秆、浅根、生育期短、需肥水较少且主要需肥水期与果树生长发育的关键时期错开，不与果树共有危险性病虫害或互为中间寄主。具体的可选择以下作物：绿肥作物是最理想的，如黑麦草；其次是矮秆的豆科作物，它可以提高土壤中氮素含量，如各种豆类、苜蓿、花生等；也可种植中草药，如丹参、桔梗、龙胆草等。
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